辣椒枯萎病是辣椒的主要土传病害。各地均有发生，北方连作地的病株死亡率为15%。
辣椒枯萎病于发病初期植株下部叶片大量脱落，于地面接近的茎基部皮层呈现水渍状腐烂，地上部茎叶迅速凋萎。有时病部只在茎的一侧发展，形成一条纵向的条状坏死区，后期全株枯死。部分病株地下部根系呈现水渍状软腐，皮层极易剥落，木质部变成褐色至煤烟色。在湿度大的条件下病部常产生白色或蓝绿色的霉状物。
本病由辣椒链孢霉引起。主要以厚孢子在土中越冬，或进行较长时间的腐生生活。在田间主要通过灌溉水传播，也可随病土借风吹往远处。该菌只危害甜椒、辣椒，遇适宜发病条件即从辣椒的伤口侵入或直接侵入。 潮湿或水渍田易发病，特别是雨后积水，发病更重。
防治措施：（1）发病初期用80%多菌灵可湿性粉剂800倍液，3%恶霉-甲霜水剂600倍液，或福美双600倍液，美株灌药液0.2-0.3kg，视病情连续灌2-3次。（2）酸性土壤易感病，可用土壤调理剂如硅钙钾或糖醇钙镁等将土壤ph值调至6以上，增施有机肥可减少病害发生。
