辣椒烂根应该这样处理：修剪烂根，换土重栽，控制浇水，避免积水。
排出积水需要马上到田地里挖排水沟，加强通风，风干土壤里的水，另外，后期浇水要严格控制水量。
当辣椒处于板结或盐碱化严重的土壤环境下，根烂的情况下，这时要及时给其松土，再给辣椒浇上稀薄有机肥料，使土壤达到松软透气、肥力足的状态。
辣椒出现烂根现象多是因为辣椒患了根腐病。辣椒根部腐烂，吸收水分和养分的功能逐渐减弱，最后全株死亡。雨量大，排水不好，根系活力下降，形成沤根，植株遮闭密度大、地势低洼、潮湿以及施用未腐熟的土杂肥，均会造成烂根、死棵。
对于发病初期的植株及时进行药剂防治。用微生物菌剂根腐净冲施或灌根，可增强作物抗逆、抗病能力，降低土壤土传病害和重茬死棵现象，预防青枯病、茎基腐病、根腐、立枯病、猝倒病等。
